Palestrantes
Descrição
As interações proteína-proteína (IPP) operam em quase todos os níveis de funções celulares; e a maioria das proteínas faz parte de algum tipo de complexo proteico em algum momento particular da vida de uma célula. As proteínas podem formar redes e complexos de interação em processos celulares, como replicação, transcrição e tradução do DNA; metabolismo de RNA; controle do ciclo celular; metabolismo energético; transdução de sinal; transporte de metabólitos, entre outros. (1) A construção da rede de interações proteína-proteína é essencial para o estudo das propriedades dinâmicas dos sistemas celulares. Uma rede de interação deste tipo incluiria sistemas chave, tais como vias metabólicas, cascatas de sinalização e redes de controlo de transcrição. (2) Atualmente existem muitos sistemas reais, em diversas áreas do conhecimento, e a biologia não é a exceção e apresenta um alto grau de complexidade, e o estudo das propriedades das redes, por meio de abordagens clássicas, não obteve sucesso. Existem muitos sistemas que têm um número grande de constituintes e que suas propriedades macroscópicas ou coletivas não estão, em geral, relacionadas com as propriedades de seus constituintes individuais, neste caso, estamos diante de um sistema complexo. (3) Com o advento da genômica funcional, o estudo de porque as proteínas evoluem é uma questão fundamental na evolução molecular, essa questão agora pode ser abordada em uma escala genômica ampla. Diferentes estudos de mudanças evolutivas reveladas pela análise de dados genômicos funcionais incluem dispensabilidade de proteína, nível de transcrição e número de interações proteína-proteína. Assim, fica claro que a evolução das proteínas está intimamente relacionada às redes de interação que ocorrem entre elas, portanto, é importante estudar diferentes modelos de redes proteína-proteína para aproveitar essas redes em o estudo de padrões e avaliar evidências evolutivas entre espécies e as mudanças sofridas nas redes nos processos evolutivos. Para a execução desta pesquisa será utilizado o banco de dados de BIND (Biomolecular Interaction Network Database), e a metodologia utilizada será a teoria de grafos, fractais e inteligência artificial. Como resultados, espera-se encontrar padrões claros que permitam encontrar evidências evolutivas entre as espécies estudadas.
Referências
1 ALOY, P. A. G.; RUSSELL, R. B. Ten thousand interactions for the molecular biologist. Nature Biotechnology, v. 22, p. 1317-1321, 2004. doi: 10.1038/nbt1018.
2 TESCHENDORFF, A. E. et al. Increased signaling entropy in cancer requires the scale-free property of protein interaction networks. Scientific Reports, v. 5, p. 9646-1-9646-1, 2015. doi:10.1038/srep09646.
3 DILÃO, R. A. ciência dos sistemas complexos. Técnica, n. 1, p. 5-18, mar. 1995. Disponível em: http://sd.ist.utl.pt/NonLinear_Dynamics_Group/Awareness_files/complexos.pdf. Acesso em: 22 jun. 2019.
| Apresentação do trabalho acadêmico para o público geral | Sim |
|---|---|
| Subárea | Sistemas Complexos |
