Nona Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos

Panorama energético do movimento de domínios em *Staphylococcus aureus* UDP-N-acetilglicosamina 2-epimerase

Não agendado

20m

Doutorado

Palestrante

Érika Chang de Azevedo (IFSC - USP)

Descrição

Staphylococcus aureus é uma importante causa de infecções associadas ao sistema de saúde em todo o mundo. (1) Foi demonstrado em diversos trabalhos que a parede de ácidos teicóicos (WTA ou Wall Teichoic Acid) pode apresentar um alvo importante na ação contra células resistentes a antibióticos. (2) A UDP-N-acetilglicosamina (UDP-GlcNac) 2-epimerase de Staphylococcus aureus, MnaA (PBD ID: 5ENZ), é uma das primeiras enzimas que compõem a via de biossíntese da WTA. (3) Neste trabalho, simulações de dinâmica molecular detalhadas da proteína MnaA foram utilizadas para caracterizar as mudanças conformacionais que ocorrem na presença de UDP e UDP-GlcNac, bem como o panorama energético associado a essas mudanças. Utilizando diferentes técnicas de simulação, como ABMD e GAMD, foi possível acessar o perfil energético para a proteína com e sem ligantes em seu sítio ativo. Nós encontramos que o movimento da proteína é descrito por um perfil energético dinâmico, o qual tem seu mínimo modificado pela presença dos ligantes, com um estado de conformação fechada sendo mais frequentemente observada no estado ligado, enquanto a proteína em seu estado não ligado favorece uma conformação aberta. Posteriores estudos estruturais indicaram que aminoácidos positivamente carregados associados à interação com o UDP e UDP-GlcNac possuem maior influência sobre o movimento de abertura da enzima. Finalmente, o perfil de energia obtido neste trabalho fornece conclusões importantes para o planejamento de inibidores que que têm como alvo a MnaA.

Referências

1 ROEMER, T.; SCHNEIDER, T.; PINHO, M. G. Auxiliary factors: a chink in the armor of MRSA resistance to beta-lactam antibiotics. Current Opinion in Microbiology, v. 16, n. 5, p. 538-548, 2013.
2 SOBHANIFAR, S. et al. Structure and mechanism of Staphylococcus aureus TarM, the wall teichoic acid alpha-glycosyltransferase. Proceedings of the National Academy of Sciences v. 112, n. 6, p. E576-585, 2015.
3 MANN, P. A. et al Chemical genetic analysis and functional characterization of staphylococcal wall teichoic acid 2-epimerases reveals unconventional antibiotic drug targets. PLOS Pathogens, v. 12, n.5, e1005585, 2016.